西元 2002 年配合行政院「挑戰 2008：國家重點發展計畫」專案提出設所申請，隔年 2003 年奉行政院核定並給予員額，繼清華大學、交通大學之後，成為國內第三個成立之科技法律研究所，為技職教育體系第一所法律研究所。自 2004 年開始招生，成立第一屆碩士班，自 2004 年起至 2010 年的前七屆碩士班招生員額為 15 名學生；2011 年第八屆為 17 名學生；自 2012 年第九屆起招生員額為 19 名；自 2017 年第 14 屆起招生員額為 21 名；自 2019 年第 16 屆起招生員額為 26 名。另一方面，2006 年奉准成立碩士在職專班，招生員額為 24 名，並於同年招收第一屆碩士在職專班學生。

本所師資陣容堅強，除了專任教師具備深厚基礎法學學養，並且具備跨領域之研究能力。專業技術人員教師也具有相當實務經歷，兼任教師亦同樣具備專業學識與能力，並曾聘請姊妹所日本大阪工業大學智慧財產權研究所的則近憲佑、山崎攻等數名教授擔任客座教授。

為服務業界，本所於 2004 年成立「科技法律諮詢中心」；2005 年成立「專利侵害鑑定中心」；2006 年規劃並設立「科技法律資料中心」，不僅服務業界，並且與司法界及學術各界資訊接軌，讓學生有更進一步學習與實際接觸法律相關領域的機會。